Ennen tutkimusta pyydämme Teitä pukemaan ylle kertakäyttöiset tutkimushousut, ja tarvittaessa voitte käyttää wc-tä. Kolonoskopian kesto on 20–30 minuuttia. Tutkimuksen aikana makaate vasemmalla kyljellä, jalat hieman koukistettuina polvista. Epämiellyttävin osa Teille on kolonoskoopin sisäänvientivaihe. Epämukavuuden lievittämiseksi käytämme kipugeeliä. Suolen limakalvo ei tunne kipua, mutta suoli on herkkä venytykselle. Tutkimuksen aikana voitte tuntea epämukavuutta, täyden vatsan tunnetta ja jonkin verran kaasukipua. Voi esiintyä ulostamistarve, joka on normaalia. Väliaikaisen kiputunteen voi aiheuttaa suolen luonnollisten mutkien ohittaminen. Koska jokaisen potilaan anatomia vaihtelee, toimenpiteen kesto ja kulku ovat hieman erilaiset. Potilaan mukavuuden lisäämiseksi harjoitamme kivutonta kolonoskopian periaatteita: tutkimuksen aikana käytämme kolonoskoopin sisäänvientiin kaasun sijaan vettä, mikä vähentää merkittävästi suolen venytyksestä aiheutuvaa kipua. Suolen tarkastuksessa käytämme CO₂-kaasua, joka imeytyy suolistosta huomattavasti nopeammin kuin tavallinen ilma ja aiheuttaa vähemmän kipua. Tutkimuksen aikana pyydämme Teitä rentoutumaan eikä pidättelemään suolistoon kertynyttä kaasua, vaan päästävän sen pois. Halutessanne voitte seurata koko tutkimuksen kulkua itse näytöltä.

Kolonoskopia muuttuu Teille merkittävästi helpommaksi, kun pääsemme kolonoskoopilla paksusuolen alkuun (ohutsuolen ja paksusuolen liittymäkohtaan). Kolonoskoopin vetäessä takaisin tutkimus helpottuu Teille joka hetkellä. Kolonoskoopin vetäminen ulos mahdollistaa suolen limakalvon tarkan tarkastelun. Tarvittaessa otamme epäilyttäviltä alueilta koepaloja, ja voimme myös välittömästi elektrokirurgisella lingolla poistaa pienempiä hyvänlaatuisia esivaiheen kasvaimia (polyyppeja) ja tarvittaessa tuoda ne tutkimusta varten ulos. Elektrokirurgisten instrumenttien käytön aikana kiinnitetään kehollesi (useimmiten jalkaan) laastaritapainen elektrodi. Biopsian ottaminen ja polyyppien poisto eivät aiheuta kipua.